분당 스타트업 세무기장 — 개발자를 전부 3.3%로 두면 투자 실사에서 돌아옵니다 (분당 스타트업 세무사)






개발자 아홉 명이 전부 3.3%였던 팀이 있었습니다(각색 예시입니다). 시드 투자를 받고 실사를 준비하다가 인건비 구조를 처음 들여다봤는데, 아홉 명 중 일곱 명이 출근 시간이 정해져 있고 회사 노트북으로 회사 일만 하고 있었습니다. 분당 스타트업 세무기장에서 가장 많이 보는 장면이 이것입니다.
이 팀이 3.3%를 택한 이유는 나쁜 뜻이 아니었습니다. 창업 초기에 4대보험 부담이 버거웠고, 개발자분들도 당장 손에 쥐는 금액이 커서 좋다고 하셨습니다. 문제는 그 선택이 몇 년 뒤에 한꺼번에 돌아온다는 점입니다. 실질이 근로자로 판정되면 4대보험이 소급 추징될 수 있고, 투자 실사에서 우발채무로 잡히면 밸류에이션에도 영향을 줍니다. 분당 스타트업 세무기장를 상담하면서 "지금이라도 바꾸는 게 손해 아닌가요"라는 질문을 자주 받는데, 미루는 비용이 훨씬 큽니다.
이 글은 달력 순서로 썼습니다. 매월 해야 할 일, 분기마다 볼 것, 반기와 연말에 정리할 것, 그리고 투자 라운드를 앞두고 미리 손봐야 할 것입니다. 저희는 전국 100% 온라인 기장이라 성남 분당에서도 카톡으로 자료 주시고 홈택스 수임동의만 해 주시면 그날 시작됩니다.
개발자는 3.3%로 해도 되나요, 아니면 4대보험인가요
분당 스타트업 세무기장에서 가장 먼저 정리해야 할 것이 인력 구분입니다. 3.3% 사업소득 처리는 실질이 프리랜서일 때만 맞습니다. 계약서 제목이 무엇이든 실제 근무 모습으로 판단합니다.
판단 기준은 복합적입니다. 출퇴근 시간이 정해져 있는지, 업무 지시를 받는지, 다른 회사 일을 병행할 수 있는지, 회사 장비를 쓰는지, 보수가 일한 시간에 비례하는지, 전속으로 묶여 있는지를 함께 봅니다. 스타트업은 이 경계가 특히 흐릿합니다. 창업 멤버는 지분도 있고 자율성도 크지만 사실상 풀타임이고, 사이드로 들어온 디자이너는 재택이지만 매일 스탠드업에 들어옵니다. 애매한 사람을 전부 3.3%로 밀어 두는 것이 가장 위험한 선택입니다. 근로자 1인 이상이면 4대보험 사업장 가입 의무가 있고, 주 15시간 미만 등 예외는 보험별로 다르니 시점 기준으로 확인하셔야 합니다.
| 판단 항목 | 프리랜서에 가까움 | 근로자에 가까움 |
|---|---|---|
| 근무 시간 | 본인이 정하고 시간 제약 없음 | 코어타임·출퇴근 시간이 정해짐 |
| 업무 지시 | 산출물만 합의, 과정은 자율 | 일일 단위로 업무를 배정받음 |
| 겸업 | 다른 회사 일 병행 가능 | 전속, 겸업 제한 |
| 장비 | 본인 장비 사용 | 회사 노트북·계정 지급 |
| 보수 산정 | 프로젝트·산출물 단위 | 월 고정급, 근무일수 연동 |
| 조직 편입 | 조직도 밖 | 팀에 배치되고 평가 대상 |
※ 실제 판정은 개별 사정을 종합해 이뤄지므로 어느 한 항목만으로 결론 내리지 않습니다.
매달 10일과 말일에는 무엇을 하나요
분당 스타트업 세무기장의 기본 리듬은 매월 10일과 말일입니다. 이 두 날만 지켜도 원천세 관련 사고의 대부분이 사라집니다.
원천세 신고와 납부는 매월 10일이고, 반기납부 승인을 받으셨다면 7월 10일과 1월 10일입니다. 상시 인원이 적은 초기 스타트업은 반기납부를 신청해 두는 경우가 많은데, 인원이 늘면 요건에서 벗어날 수 있으니 매년 다시 확인하셔야 합니다. 지급명세서는 주기가 짧아졌습니다. 사업소득 간이지급명세서는 매월 말일 제출이고, 근로소득 간이지급명세서도 2026년 1월분부터 매월 제출로 바뀌었습니다. 일용직을 쓰셨다면 일용근로소득 지급명세서도 매월입니다.
| 주기 | 해야 할 일 | 대상 |
|---|---|---|
| 매월 10일 | 원천세 신고·납부 | 근로소득 · 사업소득(3.3%) · 기타소득 |
| 매월 10일 (반기 승인 시) | 7월 10일 · 1월 10일로 대체 | 요건 충족 사업장 |
| 매월 말일 | 사업소득 간이지급명세서 | 3.3% 프리랜서 개발자 · 디자이너 |
| 매월 말일 | 근로소득 간이지급명세서 | 2026년 1월분부터 매월 |
| 매월 말일 | 일용근로소득 지급명세서 | 단기 인력 |
| 매월 마감 | 클라우드·구독 결제 내역 확인 | 해외 결제분 구분 |
※ 기한이 토요일·공휴일이면 다음 영업일입니다. 반기납부 요건은 시점 기준으로 확인하십시오.
스타트업 매출과 지원금은 어떻게 구분해 잡나요
분당 스타트업 세무기장에서 초기 팀이 가장 많이 헷갈리는 부분이 "들어온 돈이 전부 매출인가"입니다. 통장에 찍힌 돈 중 매출이 아닌 것이 꽤 많습니다.
투자금은 매출이 아니라 자본입니다. 정부지원과제 사업비도 매출과 성격이 다르고, 과제 종류와 협약 내용에 따라 회계 처리가 달라지므로 협약서를 보고 판단해야 합니다. 반대로 구독 매출은 받은 달에 전부 매출이 아닐 수 있습니다. 연간 구독료를 선결제로 받으셨다면 기간에 나눠 인식하는 것이 일반적인데, 계약 조건에 따라 달라질 수 있어 단정하지 않습니다. 해외 고객에게 받은 대금이나 앱마켓 정산금은 영세율 적용 여부와 대리납부 판단이 필요한 구간이라 건건이 확인하는 편이 안전합니다.
| 스타트업에 들어오는 돈 여섯 가지 | 성격 | 장부에서 주의할 점 |
|---|---|---|
| SaaS 구독료 (월 · 연간) | 매출 | 연간 선결제는 기간 귀속 검토 필요 |
| 용역 개발 수주 대금 | 매출 | 기성 단계별 세금계산서 발행 시기 |
| 앱마켓 · 플랫폼 인앱결제 정산금 | 매출 | 수수료 차감 전 총액인지 확인 |
| B2B 라이선스 · 광고 수익 | 매출 | 해외 고객이면 영세율 판단 필요 |
| 정부지원과제 사업비 | 매출 아님 (협약 확인) | 집행 증빙을 별도 관리 |
| 투자금 (시드 · 프리A 등) | 자본 | 매출로 잡지 않음, 주주명부 관리 |
※ 총액·순액 판정, 귀속 시기, 영세율·대리납부 여부는 계약과 거래 형태에 따라 달라질 수 있습니다.
연말에는 무엇을 정리해야 하나요
분당 스타트업 세무기장에서 연말에 몰리는 일이 셋 있습니다. 연말정산, 결산, 그리고 지급명세서 마무리입니다.
법인이라면 규모와 관계없이 복식부기 의무가 있고 매년 결산을 거쳐 법인세를 신고합니다. 12월 결산법인이면 신고 기한은 3월 말입니다. 결산에서 스타트업이 특히 신경 쓸 항목은 개발 관련 지출의 성격 구분입니다. 어떤 지출이 그 해 비용이고 어떤 것이 여러 해에 걸친 자산인지는 개발 단계와 요건에 따라 달라지므로, 숫자가 커지기 전에 기준을 정해 두시는 편이 좋습니다. 거래 단위 100만 원 이하 자산은 그 해 비용으로 바로 넣을 수 있고 그보다 크면 감가상각으로 나눕니다. 개인사업자 형태라면 종합소득세가 5월 31일, 성실신고확인 대상이면 6월 30일이고 중간예납은 11월입니다.
| 연말·연초 일정 | 스타트업이 확인할 것 |
|---|---|
| 12월 | 인력 구분 재점검 · 미지급 급여와 상여 확정 |
| 1월 | 근로소득 연말정산 자료 수집 |
| 1월 25일 | 부가세 확정신고 (법인은 예정신고 4/25 · 10/25) |
| 2월 말 | 연말정산 환급·추가징수 반영 |
| 3월 말 | 법인세 신고 (12월 결산법인) |
| 상시 | 지급명세서 제출 누락분 확인 |
※ 기한이 토요일·공휴일이면 다음 영업일이며, 세부 기한은 시점 기준으로 확인하십시오.
투자 라운드를 앞두고 미리 손볼 것은 무엇인가요
분당 스타트업 세무기장를 맡은 팀 중 투자 유치를 준비하시는 곳에는 실사 전에 반드시 보는 목록이 따로 있습니다. 실사에서 터지면 되돌릴 시간이 없기 때문입니다.
가장 많이 지적받는 것이 앞에서 본 인력 구분입니다. 그다음이 미신고 인건비, 대표 가지급금, 지급명세서 미제출, 그리고 계약서 없이 진행된 외주 거래입니다. 전부 평소에 매달 닫아 두면 생기지 않는 항목인데, 몰아서 정리하려면 몇 달이 걸립니다. 저희는 매월 예상세금 리포트로 사업분석, 매출매입, 예상부가세, 매출장·매입장, 부가세 신고분석을 보내 드리는데, 실사 준비는 사실 이 리포트가 쌓여 있는지 여부로 거의 결정됩니다.
| 실사에서 보는 항목 | 평소에 해 둘 일 |
|---|---|
| 인력 구분 (3.3% 비중) | 애매한 인원을 매 분기 재분류 |
| 4대보험 가입 현황 | 입사 시점에 바로 취득 신고 |
| 미신고 인건비 유무 | 지급과 신고를 같은 달에 맞춤 |
| 대표 가지급금 잔액 | 법인 통장과 개인 통장 분리 운영 |
| 지급명세서 제출 이력 | 매월 말일 제출을 루틴화 |
| 외주 계약서와 세금계산서 일치 | 계약 → 발행 → 수취를 한 폴더에 |
| 스톡옵션 · 주식보상 처리 | 부여 시점에 처리 방식을 먼저 확인 |
※ 주식보상 관련 세무 처리는 설계 방식에 따라 크게 달라지므로 부여 전에 확인이 필요합니다.
자주 묻는 질문
스타트업 인건비 자가진단 일곱 문항
두 번째 문항에 "아니오"가 나왔다면 그 인원은 다시 보셔야 합니다. 분당 스타트업 세무사를 알아보고 계신다면 인력 명단과 최근 석 달 지급 내역만 보여 주셔도 어디가 위험한지 짚어 드릴 수 있습니다.
※ 자체 실적 기준
위너세무회계 기장이 다른 점 여섯 가지
기장 상담은 어떻게 시작하나요
지금 쓰고 계신 장부가 괜찮은지, 바꾸는 게 나은지부터 무료로 봐 드립니다. 성남 분당에서도 전국 온라인 기장으로 카톡 자료 전달과 홈택스 수임동의만으로 바로 시작하실 수 있고, 대표세무사 방문 상담은 사전 예약으로 전국 어디든 가능합니다. 분당 스타트업 세무사를 알아보고 계신다면 장부 한 달치만 보여 주셔도 진단이 됩니다.
| 문의 방법 | 내용 |
|---|---|
| 전화 | 031-546-8146 |
| 카카오톡 상담 | pf.kakao.com/_mxjxcpG/chat |
| 네이버 톡톡 | talk.naver.com/W5U1FJ |
| 이메일 | winner1008@winnertax.kr |
| 상담 시간 | 평일 09:00~22:00 (점심 12~13시) · 주말·공휴일 근무 |
| 사무실 | 경기도 수원시 영통구 하동 1016-1, 2210~2211호 (SK뷰레이크, 광교중앙역 인근) |
기장료는 업종과 거래 규모에 따라 달라집니다. 무료 상담에서 장부 상태를 보고 견적을 알려 드리니, 금액부터 궁금하셔도 편하게 물어보시면 됩니다. 상호는 위너세무회계이고, 대표세무사 나승리가 직접 검토하고 직접 상담드립니다.
※ 본 칼럼은 일반적인 세무 정보 제공을 목적으로 하며 개별 사안에 대한 세무 자문을 대체하지 않습니다. 본문의 사례와 금액은 이해를 돕기 위한 각색 예시이고, 실적 수치는 자체 실적 기준입니다. 세법의 요율·기준금액·한도는 수시로 바뀌므로 반드시 신고 시점 기준으로 확인하셔야 합니다. 절세는 실제로 쓰신 지출 중 놓친 것을 챙기시라는 뜻이지 없는 지출을 만들라는 뜻이 아닙니다. 상담 결과나 절세 효과를 보장하지 않습니다. · 세무 광고